28 de Septiembre | Online
Los genes de fusión se han reconocido como acontecimientos impulsores durante la tumorigénesis durante décadas, facilitando la eficacia en el diagnóstico clínico y la terapia dirigida. El evento específico del tumor de los genes de fusión a los tejidos neoplásicos y sus funcionalidades oncogénicas durante la carcinogénesis los convierten en herramientas prometedoras en la batalla contra el cáncer. Sobre la base de los estudios del oncogen BCR-ABL, se desarrolló una terapia dirigida, el imatinib, que se dirigió directamente a la quinasa ABL además de algunas otras quinasas. Esto creó una prueba predictiva, así como un indicador de la respuesta terapéutica.
Con los avances en las tecnologías de secuenciación y la biología computacional, un aumento en la identificación de los genes de fusión ha acelerado la traducción clínica de estos marcadores internos en biomarcadores con utilidad clínica. Las tecnologías de secuenciación de alto rendimiento, la secuenciación del genoma completo, del exoma completo y del ARN facilitan la detección de nuevas fusiones en los tumores. Sin embargo, no son prácticas en lo que respecta al costo y la eficiencia en el contexto del diagnóstico clínico molecular. Aquí empleamos un enfoque de secuenciación de ARN dirigida con bajos requisitos de entrada de ARN. Se utilizó el enriquecimiento basado en la PCR del múltiplex anclado (AMP™) para identificar rápidamente una amplia gama de fusiones de genes. AMP es una tecnología de enriquecimiento de objetivos que aumenta significativamente la sensibilidad de la detección de fusiones de genes por ARN-seq, permitiendo la detección de transcripciones quiméricas con una resolución de una sola molécula.
Recientemente, las fusiones de FGFR han generado un interés significativo como posibles biomarcadores para el diagnóstico molecular terapéutico y clínico en diversos cánceres, incluido el cáncer biliar o el colangiocarcinoma. Aquí realizamos la secuenciación del ARN de enriquecimiento de objetivos AMP del FGFR1-3, validado por la secuenciación de FISH y Sanger, en 121 tumores de colangiocarcinoma asociado a la gripe y 95 no asociados a la gripe (CCA).
Ponente:
Sarinya Kongpetch, Ph.D.
