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GeoMx Whole Transcriptome Atlas (WTA)
CatálogoOncologíaTumor sólido
Estudio espacial, exhaustivo y pormenorizado de la biología celular, con una cobertura total de los genes codificantes, y aplicación en diversos campos: oncología, inmunología, neurociencia, biología del desarrollo...
El panel GeoMx® Whole Transcriptome Atlas (WTA) está diseñado para realizar un estudio transcriptómico espacial completo en humano o ratón, seleccionando regiones de interés en el tejido (fresco, congelado o fijado) y obtener el perfil de expresión de forma precisa sin dañar el tejido o microdiseccionarlo.
Este panel posibilita el análisis de más 18.000 genes, permitiendo una cobertura total de los genes codificantes.
- Perfilado espacial: Posibilidad de explorar la expresión génica en regiones de interés, pudiendo identificar el contenido celular y las rutas metabólicas implicadas.
- Descubrimiento de biomarcadores: Localización y expresión de dianas terapéuticas "in situ" que permitan identificar procesos y respuestas a tratamientos.
- Análisis de rutas: El contenido anotado permite conocer el estado de activación de vías de señalización dentro de los compartimentos de interés del tejido.
El GeoMx® WTA es compatible con la tecnología RNAscope® y con anticuerpos para el marcaje morfológico que posibilitan la selección de las regiones de interés en el tejido.
La lectura se realiza mediante secuenciación masiva (NGS) en plataformas Illumina, y dispone del software GeoMx DSP data center, una solución bioinformática integral que te permitirá desde la selección de las regiones de interés (ROIs) y la toma de imágenes, hasta un análisis de datos totalmente integrado.
Para más información sobre este panel, por favor, consulte la ficha de producto que puede descargar más abajo.
Presentaciones
| Producto | Descripción del producto | Cantidad | Nº Catálogo |
|---|---|---|---|
| Panel para ARN Humano GeoMx Human Whole Transcriptome Atlas para Sistemas Illumina | Panel de ARN dirigido a más de 18000 tránscritos correspondientes a genes codificantes de proteínas humanas, además de controles negativos ERCC, para cubrir el trasncriptoma completo. Excluye dianas altamente expresadas no informativas, como las subunidades ribosómicas. Incluye sondas de ARN diseñadas para la lectura por NGS con sistemas de Illumina, con el Seq Code library prep | 4 muestras | GMX-RNA-NGS-HuWTA-4 |
| Panel para ARN Murino GeoMx Mouse Whole Transcriptome Atlas para Sistemas Illumina (disponible bajo pedido) | Panel de ARN dirigido a más de 21.000 tránscritos correspondientes a genes codificantes de proteínas de ratón, además de controles negativos ERCC, para cubrir el trasncriptoma completo. Excluye dianas altamente expresadas no informativas, como las subunidades ribosómicas. Incluye sondas de ARN diseñadas para la lectura por NGS con sistemas de Illumina, con el Seq Code library prep | 4 muestras | GMX-RNA-NGS-MsWTA-4 |
| Kit de marcadores morfológicos GeoMx Solid Tumor TME compatible con ARN humano | Kit con los marcadores morfológicos para la visualización de tumores sólidos humanos y el microambiente tumoral. Para uso con ensayos de ARN. Incluye anticuerpos fluorescentes contra Pan-CK, CD45, y un colorante nuclear | 12 muestras | GMX-RNA-MORPH-HST-12 |
| Kit de marcadores morfológicos GeoMx Melanoma TME compatible con ARN humano | Kit con los marcadores morfológicos para la visualización de melanoma humano y el microambiente tumoral. Para uso con ensayos de ARN. Incluye anticuerpos fluorescentes contra S100B/Pmel17, CD45, y un colorante nuclear | 12 muestras | GMX-RNA-MORPH-HMEL-12 |
| GeoMx Seq Code Pack compatible con Sistemas Illumina | Reactivos de NGS para análisis de ARN y proteínas mediante GeoMx DSP. Incluye dos placas con primers Seq Code (elección de A&B, C&D, E&F, o G&H) y dos master mixes universales | 192 áreas de interés (AOI) | GMX-NGS-SEQ-[XX] |
| Kit de preparación de muestras (ARN) GeoMx para FFPE | Reactivos para la preparación de muestras para el análisis de ARN con GeoMx DSP. Incluye Buffer W, Buffer S, y Buffer R | 12 muestras | GMX-PREP-RNA-FFPE-12 |
| Placa de colección GeoMx DSP | Placas de colección con código de barras para su uso en GeoMx DSP. Necesarias para el seguimiento de las AOI. El kit incluye 12 placas para cubrir 1152 AOI | 1 Pack | GMX-DSP-COLL-PLT |
| Kit con el buffer para el instrumento GeoMx DSP | Kit con el buffer para el GeoMx DSP. Incluye Buffer S y Buffer H, para -48 muestras con -18 AOI cada una. El volumen necesario puede variar en función del diseño experimental. | 1 kit | GMX-DSP-BUFF-KIT |
