CellScape™ Precise Spatial Proteomics

La plataforma CellScape™ Precise Spatial Proteomics es una solución optimizada de inmunofluorescencia multiplexada (mIF) para la detección espacial de proteínas de alto plex y el fenotipado cuantitativo. Al combinar un sistema avanzado de imagen con microfluídica integrada para una automatización “walk-away”, y un ecosistema abierto basado en una química sencilla y un rendimiento robusto, la plataforma CellScape acelera el descubrimiento biológico y la investigación traslacional en múltiples disciplinas.

Plataforma CellScape

Aspectos Clave

Imagen de alta resolución con muestreo digital de 182 nm/píxel. 
Proteómica espacial a nivel unicelular y subcelular. 
Imagen de alto rango dinámico (HDR) para la detección precisa de biomarcadores de baja y alta expresión. 
Imagen de portaobjetos completos en áreas tisulares >700 mm². 
Flujo de trabajo automatizado “walk-away” con microfluídica integrada. 
Diseño abierto de ensayos utilizando anticuerpos primarios conjugados con fluoróforos disponibles comercialmente. 
Compatibilidad con más de 6.000 anticuerpos validados. 
Ensayos ampliables mediante ciclos iterativos de tinción e imagen. 
Química EpicIF™ de eliminación de señal para borrar suavemente la fluorescencia preservando el tejido. 
Salidas estándar OME-TIFF compatibles con software común de análisis de imágenes. 
Compatible con tejidos FFPE, tejidos congelados frescos y suspensiones celulares.

¿Cómo funciona?

CellScape™ utiliza un flujo de trabajo iterativo basado en inmunofluorescencia cíclica. Las muestras se tiñen con anticuerpos fluorescentes conjugados directamente, se obtienen imágenes de alta resolución y posteriormente se someten a la química de eliminación de señal EpicIF™ para borrar las señales fluorescentes sin dañar la morfología tisular ni los epítopos. El proceso puede repetirse múltiples veces para generar conjuntos de datos de proteómica espacial altamente multiplexados a partir de una misma muestra.

La plataforma integra:

Microfluídica automatizada para la dispensación de reactivos.  Imagen óptica HDR para detección cuantitativa de biomarcadores.  Alineamiento automático de imágenes entre ciclos.  Expansión flexible de ensayos con biomarcadores adicionales en cualquier etapa del experimento. 

Este flujo de trabajo permite un fenotipado cuantitativo preciso y el análisis espacial de tejidos complejos con resolución unicelular.

Flujo de trabajo simple y directo desde la preparación de muestras hasta la generación de imágenes:

Flujo de trabajo CellScape

Aplicaciones

Perfilado espacial de microambientes tumorales.  Investigación en inmuno-oncología.  Descubrimiento y validación de biomarcadores.  Investigación traslacional y clínica.  Fenotipado de células inmunes.  Investigación en neurociencia.  Estudios de enfermedades infecciosas.  Análisis de interacciones célula-célula.  Estudios longitudinales y basados en hipótesis en biología espacial.  Flujos de trabajo multi-ómicos que integran transcriptómica y proteómica.

Paneles disponibles: Kits VistaPlex™ Assay

Paneles multiplexados de anticuerpos prevalidados diseñados para una implementación rápida y un desarrollo de ensayos optimizado.

CellScape™ Data Explorer

CellScape™ Data Explorer es una plataforma interactiva basada en navegador que permite explorar conjuntos de datos reales de proteómica espacial de alto plex generados con CellScape™ y los kits VistaPlex™ Assay.

El Data Explorer permite:

Visualización interactiva de datasets de proteómica espacial directamente en el navegador.  Zoom fluido desde la arquitectura tisular completa hasta detalles unicelulares.  Visualización individual de marcadores y análisis de superposición.  Exploración de regiones tisulares a múltiples escalas espaciales.  Superposición de fenotipos y segmentación para análisis de organización celular.  Evaluación de especificidad de tinción y localización de marcadores.  Evaluación de relaciones espaciales dentro de los tejidos. 

Los datasets representativos demuestran la capacidad de la plataforma para combinar:

Resolución espacial líder en su categoría.  Imagen de alto rango dinámico.  Análisis cuantitativo de biomarcadores.  Amplia cobertura tisular con detalle a nivel celular.

Datasets de imágenes disponibles comercialmente:

Human FFPE Breast Cancer Human FFPE Colorectal Cancer Human FFPE Head & Neck Cancer Human FFPE Melanoma

CellScape™ Data Explorer proporciona una vista previa práctica de la profundidad, calidad e información biológica que la plataforma CellScape™ puede generar en múltiples tipos de muestras y aplicaciones de investigación.

CellScape Data Explorer
Más información: CellScape™ Precise Spatial Proteomics Overview

Área:

Proteómica, Ómicas

Tecnología:

Marca:

Consulta a nuestros expertos

Google reCaptcha: Clave de sitio no válida.

Productos relacionados

Hedera Profiling RNA Test Panel

Panel NGS in house de enriquecimiento dirigido para el perfilado de ARN a partir de muestras de tejido (FFPE). Analiza 43 genes mediante un diseño de sondas ancladas a límites exónicos (splice-aware). Detecta fusiones de manera agnóstica al gen compañero (partner-agnostic), variantes de splicing complejas y perfiles de expresión génica en un único flujo de…
HederaDx
Secuenciación masiva (NGS)

Hedera Profiling ctDNA 3

Panel NGS in house de enriquecimiento dirigido exclusivo para biopsia líquida (cfDNA). Analiza 43 genes con evidencia clínica ESCAT I y II. Incluye la preparación de librerías mediante un flujo de trabajo optimizado (DNA-only) para muestras de plasma. Detecta SNVs, Indels, CNVs, fusiones y 36 marcadores de inestabilidad microsatelital (MSI). Descripción Detallada Principio de funcionamiento…
HederaDx
Secuenciación masiva (NGS)

Hedera Profiling 1 FFPE Test Panel (HP1)

Panel NGS in house de enriquecimiento dirigido para el perfilado pancáncer en tumor sólido. Analiza 115 genes (79 con CDS completo) con evidencia clínica ESCAT I, II y III. Incluye la preparación de librerías mediante un flujo flexible que permite procesar muestras FFPE y cfDNA conjunta o separadamente. Detecta SNVs, Indels, CNVs, fusiones, variantes estructurales…
HederaDx
Secuenciación masiva (NGS)

Sepsis Pathogenic Microorganism Detection Kit (Digital PCR)

Kit de diagnóstico in vitro basado en PCR digital en gotas (droplet digital PCR, dPCR) para la detección de microorganismos patógenos asociados a sepsis a partir de ADN extraído de muestras clínicas. El kit permite identificar y cuantificar patógenos sin requerir hemocultivo, cubriendo 21 agentes frecuentes en infecciones del torrente sanguíneo. Descripción Detallada Principio de…
RainSure
PCR Digital