CellScape™ Precise Spatial Proteomics

La plataforma CellScape™ Precise Spatial Proteomics es una solución optimizada de inmunofluorescencia multiplexada (mIF) para la detección espacial de proteínas de alto plex y el fenotipado cuantitativo. Al combinar un sistema avanzado de imagen con microfluídica integrada para una automatización “walk-away”, y un ecosistema abierto basado en una química sencilla y un rendimiento robusto, la plataforma CellScape acelera el descubrimiento biológico y la investigación traslacional en múltiples disciplinas.

Plataforma CellScape

Aspectos Clave

Imagen de alta resolución con muestreo digital de 182 nm/píxel. 
Proteómica espacial a nivel unicelular y subcelular. 
Imagen de alto rango dinámico (HDR) para la detección precisa de biomarcadores de baja y alta expresión. 
Imagen de portaobjetos completos en áreas tisulares >700 mm². 
Flujo de trabajo automatizado “walk-away” con microfluídica integrada. 
Diseño abierto de ensayos utilizando anticuerpos primarios conjugados con fluoróforos disponibles comercialmente. 
Compatibilidad con más de 6.000 anticuerpos validados. 
Ensayos ampliables mediante ciclos iterativos de tinción e imagen. 
Química EpicIF™ de eliminación de señal para borrar suavemente la fluorescencia preservando el tejido. 
Salidas estándar OME-TIFF compatibles con software común de análisis de imágenes. 
Compatible con tejidos FFPE, tejidos congelados frescos y suspensiones celulares.

¿Cómo funciona?

CellScape™ utiliza un flujo de trabajo iterativo basado en inmunofluorescencia cíclica. Las muestras se tiñen con anticuerpos fluorescentes conjugados directamente, se obtienen imágenes de alta resolución y posteriormente se someten a la química de eliminación de señal EpicIF™ para borrar las señales fluorescentes sin dañar la morfología tisular ni los epítopos. El proceso puede repetirse múltiples veces para generar conjuntos de datos de proteómica espacial altamente multiplexados a partir de una misma muestra.

La plataforma integra:

Microfluídica automatizada para la dispensación de reactivos.  Imagen óptica HDR para detección cuantitativa de biomarcadores.  Alineamiento automático de imágenes entre ciclos.  Expansión flexible de ensayos con biomarcadores adicionales en cualquier etapa del experimento. 

Este flujo de trabajo permite un fenotipado cuantitativo preciso y el análisis espacial de tejidos complejos con resolución unicelular.

Flujo de trabajo simple y directo desde la preparación de muestras hasta la generación de imágenes:

Flujo de trabajo CellScape

Aplicaciones

Perfilado espacial de microambientes tumorales.  Investigación en inmuno-oncología.  Descubrimiento y validación de biomarcadores.  Investigación traslacional y clínica.  Fenotipado de células inmunes.  Investigación en neurociencia.  Estudios de enfermedades infecciosas.  Análisis de interacciones célula-célula.  Estudios longitudinales y basados en hipótesis en biología espacial.  Flujos de trabajo multi-ómicos que integran transcriptómica y proteómica.

Paneles disponibles: Kits VistaPlex™ Assay

Paneles multiplexados de anticuerpos prevalidados diseñados para una implementación rápida y un desarrollo de ensayos optimizado.

CellScape™ Data Explorer

CellScape™ Data Explorer es una plataforma interactiva basada en navegador que permite explorar conjuntos de datos reales de proteómica espacial de alto plex generados con CellScape™ y los kits VistaPlex™ Assay.

El Data Explorer permite:

Visualización interactiva de datasets de proteómica espacial directamente en el navegador.  Zoom fluido desde la arquitectura tisular completa hasta detalles unicelulares.  Visualización individual de marcadores y análisis de superposición.  Exploración de regiones tisulares a múltiples escalas espaciales.  Superposición de fenotipos y segmentación para análisis de organización celular.  Evaluación de especificidad de tinción y localización de marcadores.  Evaluación de relaciones espaciales dentro de los tejidos. 

Los datasets representativos demuestran la capacidad de la plataforma para combinar:

Resolución espacial líder en su categoría.  Imagen de alto rango dinámico.  Análisis cuantitativo de biomarcadores.  Amplia cobertura tisular con detalle a nivel celular.

Datasets de imágenes disponibles comercialmente:

Human FFPE Breast Cancer Human FFPE Colorectal Cancer Human FFPE Head & Neck Cancer Human FFPE Melanoma

CellScape™ Data Explorer proporciona una vista previa práctica de la profundidad, calidad e información biológica que la plataforma CellScape™ puede generar en múltiples tipos de muestras y aplicaciones de investigación.

CellScape Data Explorer
Más información: CellScape™ Precise Spatial Proteomics Overview

Área:

Proteómica, Ómicas

Tecnología:

Marca:

Consulta a nuestros expertos

Google reCaptcha: Clave de sitio no válida.

Productos relacionados

ForenSeq® Kintelligence HT Kit

Kit de preparación de librerías mediante tecnología de amplicones de 10.230 SNPs para la identificación de personas y restos humanos mediante análisis de parentesco. Su flujo de trabajo combina la preparación de librerías a partir de muestras forenses, la secuenciación en MiSeq FGx y el análisis en ForenSeq® Universal Analysis Software (UAS), que incorpora una…
Qiagen
Secuenciación masiva (NGS)

SureSelect Cancer CGP Assay

Panel pan-cáncer por NGS de enriquecimiento dirigido para el perfilado genómico completo (CGP) de tumores sólidos. Diseñado para detectar variantes somáticas a nivel de ADN (SNVs, indels, CNVs, translocaciones) y ARN (fusiones génicas), además de evaluar biomarcadores inmunooncológicos complejos como la carga mutacional tumoral (TMB), inestabilidad de microsatélites (MSI) y deficiencia de recombinación homóloga (HRD).…
Agilent
Secuenciación masiva (NGS)

SeqOne HRD Solution con Agilent SureSelect CD HRR17 Panel

Solución de análisis HRD que combina secuenciación genómica completa de baja cobertura (shallow/low-pass WGS) y panel génico dirigido para detectar inestabilidad genómica, alteraciones BRCA1/2 y otros genes relacionados con recombinación homóloga. Está diseñada para laboratorios que desean implementar el test HRD in-house con un flujo de trabajo automatizado, eficiente y validado clínicamente. Descripción Detallada La…
Agilent
Secuenciación masiva (NGS)

OncoSELECT®

Ensayo integral de biopsia líquida dirigida diseñado para respaldar la toma de decisiones en oncología mediante el análisis de 74 genes clínicamente relevantes. La solución engloba desde los reactivos para la preparación de librerías hasta el análisis bioinformático, la interpretación clínica y la generación de informes detallados. 3.- Descripción Detallada Principio de funcionamiento OncoSELECT® es…
OncoDNA
Secuenciación masiva (NGS)