La monitorización del quimerismo mediante Next Generation Sequencing (NGS) o secuenciación masiva es la opción más avanzada para la vigilancia del quimerismo y sustituye al análisis convencional de STR (short tandem repeat), debido a su mayor sensibilidad.

NGStrack proporciona datos fiables para el seguimiento del quimerismo, tanto en porcentajes altos como bajos. Además, el breve flujo de trabajo, con sólo 1,5 horas de manipulación manual, proporciona resultados rápidos y sencillos.

Distribucion de los marcadores a lo largo del genoma 1

Los reactivos NGStrack permiten la detección de un conjunto de 34 marcadores de tipo INDELs que cubren 18 cromosomas, los cuales permiten distinguir entre donante y receptor basándose en fragmentos de ADN insertados o delecionados. El kit también incluye un marcador X/Y.

NGStrack puede combinarse con las muestras NGSgo HLA en la misma flow cell. Si ya está utilizando la monitorización del quimerismo por qPCR (KMRtype, KMRtrack y AlleleSEQR) y quiere combinar o continuar con NGS, los marcadores se solapan para tener el mismo nivel informativo.

TRKengine

El software TRKengine interpreta la información de los marcadores y cuantifica el porcentaje de quimerismo en las muestras. Su uso como sistema de gestión de datos permite un seguimiento profundo del quimerismo y de las tendencias a lo largo del tiempo.

Los reactivos NGStrack y el software TRKengine son compatibles con las plataformas de secuenciación de Illumina. NGStrack puede incluirse fácilmente en el conocido flujo de trabajo de NGSgo®, que se ha utilizado con éxito en los laboratorios de HLA durante muchos años.

Beneficios

  • Sólo 1,5 horas de manipulación manual
  • Entre 2-10 veces más sensible que el análisis de STR
  • La muestra pretrasplante sólo necesita ser probada una vez

Área:

Inmunología, Médula ósea (quimerismo), Oncohematología, Quimerismo (HSCT)

Marca:

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