GeoMx™ Digital Spatial Profiler (DSP)

Esta tecnología admite muestras FFPE y congeladas frescas (FF), y permite seleccionar áreas específicas del tejido para obtener datos de expresión con resolución espacial, mediante un flujo de trabajo automatizado y escalable que se integra con técnicas estándar de tinción histológica. GeoMx DSP ofrece un alto nivel de multiplexación: desde paneles dirigidos hasta transcriptoma completo mediante NGS, junto más de 1200 proteínas validadas, lo que proporciona una visión integral del microambiente tisular.

Con GeoMx DSP, los investigadores pueden mapear la distribución espacial de biomarcadores, explorar interacciones celulares y caracterizar procesos biológicos complejos en su contexto nativo. Es ideal para estudios en oncología, inmunología, neurociencia y desarrollo de fármacos, facilitando el descubrimiento de biomarcadores y la comprensión profunda de la biología espacial.

Aspectos Clave

¿Cómo funciona?

Se tiñen portaobjetos completos con sondas del ensayo y hasta cuatro marcadores fluorescentes (marcadores morfológicos), y, posteriormente, se obtienen imágenes en el instrumento. Guiándose por los marcadores morfológicos, se decide qué regiones de interés (ROI) del tejido se desean perfilar y, mediante el uso de máscaras (áreas de iluminación, AOI), se pueden perfilar opcionalmente dos o más compartimentos tisulares o tipos celulares en cada ROI. Los niveles de expresión de ARN y proteínas se cuantifican mediante el recuento digital directo de códigos de barras utilizando el sistema nCounter® o mediante secuenciación en una plataforma Illumina. Los datos se analizan con la suite de análisis de datos DSP (DSPDA), herramientas de código abierto.

Las sondas DSP están marcadas con códigos de barras de oligonucleótidos únicos que se liberan tras la exposición a luz UV, sin dañar el tejido.

Las muestras de tejido se tiñen con sondas de imagen (marcadores morfológicos) y de ensayo marcadas con fluoróforos utilizando un flujo de trabajo histológico estándar.

Se seleccionan las regiones de interés (ROIs) y las áreas de iluminación (AOIs) en el tejido para interrogarlas. El tejido se expone a luz UV y los códigos de barras se liberan y se cuantifican posteriormente.

Se obtiene una expresión espacial no sesgada de cada máscara tisular, con sensibilidad para detectar expresores bajos, medios y altos.

Aplicaciones

Paneles disponibles:

Opciones flexibles para cubrir sus necesidades de investigación. Para más información, haga clic en el icono correspondiente:

Ensayos de ARN GeoMx DSP

GeoMx® Human Whole Transcriptome Atlas

GeoMx® Mouse Whole Transcriptome Atlas

GeoMx® Cancer Transcriptome Atlas

GeoMx® TCR Profiling Add-On

GeoMx® Canine Cancer Atlas

GeoMx® Immune Pathways Panel

Ensayos de proteínas GeoMx DSP

GeoMx® Discovery Proteome Atlas

GeoMx® ImmunoOncology Proteome Atlas

GeoMx® Immuno-Oncology Protein Panels

GeoMx® Neuroscience Protein Panels

Ensayos personalizados GeoMx DSP

GeoMx® RNA Barcoding Service (RBS)

GeoMx® Protein Barcoding Service (PBS)