SomaScan® 11K Assay v5.0
El SomaScan® 11K Assay v5.0, de Standard BioTools, es la tecnología proteómica más avanzada disponible para la caracterización global del proteoma humano. Este ensayo permite cuantificar de manera simultánea más de 10.000 proteínas únicas a partir de volúmenes reducidos de muestra (55 µL de plasma o suero), ofreciendo una cobertura sin precedentes y la posibilidad de explorar tanto proteínas de alta como de baja abundancia dentro de un rango dinámico de 10 órdenes de magnitud. Sin embargo, existe una gama más amplia de muestras (por ejemplo, LCR, líquido sinovial, medios de cultivo, entre otros) y de diferentes especies que pueden procesarse en el ensayo.
| SOMAmeros | Anticuerpos |
|---|---|
 |  |
| Secuencia corta de ADN monocatenario con nucleótidos modificados (~20 kDa) | Proteína grande de múltiples cadenas (~150 kDa) |
| Sintetizados químicamente, lo que proporciona una estructura consistente | Producida por sistemas biológicos, lo que introduce cierto grado de variabilidad natural en la estructura |
| Seleccionados por características específicas de rendimiento a partir de una biblioteca sintética de 10^15 aptámeros de ADN | La selección es aleatoria, basada en la respuesta inmunitaria |
| Se utiliza un competidor polianiónico universal en el ensayo para eliminar la unión no específica | No existe un competidor universal para eliminar la unión no específica |
| Alta especificidad (dimensiones del sitio de unión de 1100–1200 Ų) | Alta especificidad (dimensiones del sitio de unión de 1100–1200 Ų) |
El principio de funcionamiento se basa en el uso de SOMAmer® (Slow Off-rate Modified Aptamer) Reagents o SOMAmeros, aptámeros de ADN modificados quimicamente mediante la tecnología SELEX. Estas modificaciones amplían la diversidad química y mejoran la especificidad y afinidad de unión a proteínas nativas en su conformación tridimensional. Los SOMAmer actúan como reactivos de captura que, tras procesos de lavado, partición, foto-liberación y captura secuencial, generan señales cuantificables en microarrays de hibridación de ADN.
En comparación con los anticuerpos, los SOMAmeros ofrecen ventajas significativas: síntesis química estandarizada, menor variabilidad, control de afinidad mediante SELEX y reducción de la unión inespecífica, lo que se traduce en mayor robustez y reproducibilidad.
| Tipo de muestra | Volumen necesario | |
|---|---|---|
| Core | Plasma o suero humano | 130 µL (2×55 µL alícuotas) |
| Orina humana | 550 µL (2×260 µL alícuotas) | |
| Non-Core | Plasma o suero de primate no humano, perro, gato, ratón o marmota | 130µL (2×55 µL alícuotas) |
| Plasma de aspirado de médula ósea Líquido sinovial humano/perro (pretratado para reducir la viscosidad) | ||
| Plasma/suero humano de lupus eritematoso sistémico (LES) | 75 µL (2×30 µL alícuotas) | |
| Lisado celular | ||
| Homogeneizado tisular Broncoscopia y lavado Linfocitos Líquido amniótico Extracto nuclear Exosomas Líquido de la herida | 75 µL (2×30 µL alícuotas) | |
| Medios de cultivo celular Esputo Lavado nasal | 100 µL (2×40 µL alícuotas) | |
| Humor acuoso Humor vítreo | ||
| Plasma/suero bovino o de rata Saliva | 50 µL (2×15 µL alícuotas) | |
| Líquido vesicular Leche bovina | ||
| Líquido cefalorraquídeo | 100µL (2×40 µL alícuotas) |
La tecnología ha demostrado coeficientes de variación (CV) muy bajos (mediana <5% en plasma y suero), lo que permite detectar cambios proteicos sutiles con gran potencia estadística, reduciendo significativamente el tamaño de cohorte necesario en estudios clínicos.
Aplicaciones clínicas y de investigación incluyen biomarcadores en oncología, enfermedades cardiovasculares, metabólicas, inflamatorias y neurodegenerativas, así como en farmacología traslacional, ensayos clínicos y medicina de precisión.
¿Cómo funciona?
Aspectos Clave
- Cobertura de ~11.000 mediciones proteicas (más de 10.000 proteínas únicas), medidas en pequeños volúmenes de muestras biológicas.
- Requiere solo 55 µL de plasma o suero humano, u otros.
- Rango dinámico de 10 logs, detectando proteínas desde fM hasta µM.
- Alta reproducibilidad: CV mediana <5% en suero/plasma.
- SOMAmeros: aptámeros modificados químicamente con alta especificidad y estabilidad.
Para obtener más información sobre el servicio del ensayo SomaScan, consulta Citogen, único laboratorio a nivel europeo certificado por Standard Biotools para llevar a cabo este ensayo.
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