ForenSeq mtDNA Whole Genome Kit

El kit ForenSeq mtDNA Whole Genome permite una preparación de librerías cómoda y coste-eficiente para la secuenciación del genoma mitocondrial completo a partir de cantidades mínimas de ADN, con una obtención de datos excepcional.

Aprovechando la probada química ForenSeq, este kit produce conjuntos de datos ampliados que facilitan los estudios poblacionales o proporcionan una resolución adicional para muestras muy degradadas. Además, esta solución es la más económica de los ensayos comerciales de genoma mitocondrial completo. La capacidad de multiplexación aumenta aún más la eficiencia operativa sin aumentar los costes ni el tiempo de trabajo.

El kit ForenSeq mtDNA Whole Genome forma parte de un flujo de trabajo integrado que hace posible la secuenciación de las librerías en la plataforma MiSeq FGx para el posterior análisis de los datos con el software de análisis universal (UAS – Universal Analysis Software). Está diseñado, desarrollado y fabricado como una solución integral para un alto rendimiento con muestras forenses. La fabricación sometida altos controles de calidad garantiza la reproducibilidad, con la comodidad de un kit de preparación de librerías “todo en uno”.

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Aspectos clave:

  • Resultados fiables: Ensayo basado en PCR que utiliza pequeños amplicones diseñados a partir de las últimas bases de datos de ADN mitocondrial (ADNmt) para mejorar la detección de variantes. El diseño de los cebadores busca la superposición de los amplicones para evitar regiones sin cubrir y con ello la pérdida de datos, particularmente en muestras degradadas. Además, un sistema de tampones mejorado ofrece una resistencia excepcional al calcio, al ácido húmico y a otros inhibidores de la PCR relevantes.
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  • Opciones de flujo de trabajo flexibles: El protocolo incluye dos métodos de normalización para adaptar la preparación de librerías a una amplia gama de materiales de partida, desde ADN genómico (ADNg) de alta calidad hasta muestras complejas. La pequeñísima cantidad de ADN de partida necesario aumenta las posibilidades de obtener datos a partir de muestras críticas. Para un uso eficiente de los reactivos del kit y una asignación precisa de las lecturas, los índices incluidos en el kit de preparación de librerías permiten el “pooling” y secuenciación de hasta 16 muestras en una sola carrera.
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  • Bioinformática simplificada:  El kit ForenSeq mtDNA Whole Genome se complementa perfectamente con el módulo de análisis ForenSeq mtDNA del UAS para facilitar el análisis y la revisión rápida de los datos de ADNmt. El software analiza los datos de la secuenciación y proporciona resultados en menos de una hora después de la finalización de la carrera. El analista puede revisar los resultados resumidos o detallados y comparar hasta nueve muestras en una interfaz de usuario clara e interactiva. Los informes son compatibles con múltiples bases de datos de ADN.
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Especificaciones:

  • Tamaño de la región diana: 1.200 Tamaño de la región diana: 16.569 pb del genoma mitocondrial
  • Tipo de muestra: ADNg y ADNmt extraído a partir de pelo, huesos, dientes y frotis bucales
  • ADN de partida recomendado: 100 pg de ADNg por muestra
  • Configuración del kit: 48 reacciones
  • Capacidad de multiplexación: 16 librerías por carrera
  • Número de primers: > 500
  • Número de amplicones: 245
  • Tamaño medio de los amplicones: 131 pb
  • Superposición de amplicones: ≥ 3 pb
  • Tiempo de preparación manual: 1 hora y 45 minutos
  • Tiempo total de preparación de librerías: 7 horas y 45 minutos

Área:

Genética forense

Marca:

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