Sistema de tipaje HLA de alta resolución mediante NGS que permite trabajar con múltiples plataformas de secuenciación y ofrece máxima flexibilidad en el flujo de trabajo.
Descripción Detallada
HLA-SuBiTo NGStype® es una solución integral para el tipaje HLA de alta resolución basada en secuenciación de nueva generación (NGS), desarrollada por inno-train Diagnostik. El sistema permite el análisis simultáneo de hasta 11 loci HLA utilizando un enfoque de PCR de largo alcance (long range PCR), compatible con múltiples métodos de preparación de librerías y secuenciadores.
La tecnología se adapta tanto a secuenciadores de lectura corta como larga, incluyendo Illumina, Oxford Nanopore Technologies (ONT) y MGI. Esto proporciona al usuario una libertad total para elegir la plataforma de secuenciación según su infraestructura o necesidades de análisis.
El flujo de trabajo se inicia con una PCR de largo alcance que cubre los loci HLA-A, -B, -C, -DPA1, -DPB1, -DQA1, -DQB1 y DRB1/3/4/5, con amplicones de entre 3,4 y 7,4 kb. La calidad del análisis está garantizada por el uso de primers específicos y una mezcla maestra optimizada incluida en el kit.
Según el flujo de trabajo elegido, el proceso puede adaptarse para laboratorios que analizan desde una única muestra (usando MinION de ONT) hasta cientos de muestras en paralelo (usando MiSeq, MiniSeq, iSeq, entre otros). La flexibilidad es una de sus principales ventajas, junto con la escalabilidad del sistema.
La preparación de librerías puede realizarse con kits validados de terceros como NEBNext UltraExpress™ para Illumina o Rapid Barcoding Kit para ONT, y se prevé el lanzamiento de un kit propio de preparación de librerías por parte de inno-train.
El análisis de datos se realiza mediante el software NGStype®, compatible con archivos fastq provenientes de cualquier plataforma. Este software incluye algoritmos optimizados para secuencias de lectura corta y larga, permitiendo el análisis automático de haplotipos y visualización clara de resultados.
Aspectos Clave
Detalles de Presentación
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