AlloSeq cfDNA

AlloSeq cfDNA es un kit que permite, en pacientes que han recibido un trasplante de órgano sólido, la cuantificación relativa del ADN circulante que proviene del injerto mediante secuenciación masiva. Dicha cuantificación permite detectar el daño del injerto de manera temprana y ha demostrado ser más sensible que la creatinina sérica en el diagnóstico temprano del rechazo renal.

También se han publicado trabajos que señalan la utilidad de esta determinación para la monitorización de la efectividad del tratamiento para el rechazo agudo, así como para la detección de la nefropatía asociada a infección por virus BK.

Se trata de un test mínimamente invasivo, dado que la muestra empleada es plasma del paciente, del que se obtienen resultados en menos de 24 horas. Se basa en el empleo de 202 SNPs para cuantificar con precisión la proporción de ADN circulante que corresponde al órgano trasplantado.

La preparación de las librerías puede realizarse en menos de 3 horas, y consiste en una PCR multiplex en la que la amplificación de las regiones con los SNPs y la indexación de las muestras tiene lugar en la misma reacción. Las muestras son posteriormente mezcladas en un pool, que queda listo para ser purificado y secuenciado en una plataforma MiSeq.

El análisis de las secuencias se realiza de forma totalmente automática y se muestran al usuario los resultados como el porcentaje de ADN libre que corresponde al donante respecto al total.