Tecnología AMP™
Mejora la sensibilidad y precisión en la detección de alteraciones genéticas.
LIQUIDPlex™ Universal Solid Tumor
Panel de secuenciación de nueva generación para el análisis de ADN libre circulante mediante tecnología Anchored Multiplex PCR.
Descripción general
El panel LIQUIDPlex™ Universal Solid Tumor está diseñado para la secuenciación de nueva generación (NGS) a partir de ADN libre circulante (cfDNA), utilizando la tecnología patentada Anchored Multiplex PCR (AMP™).
La tecnología AMP™ (Anchored Multiplex PCR) es una plataforma patentada de enriquecimiento dirigido para secuenciación de nueva generación (NGS). Se basa en el uso de primers unidireccionales específicos de genes (GSPs) y adaptadores moleculares con códigos de barras únicos (MBCs), que se ligan al material genético antes de la amplificación. Esta estrategia permite capturar y amplificar fragmentos de ADN, ARN o cfDNA de forma eficiente, incluso en presencia de mutaciones desconocidas o secuencias altamente fragmentadas.
La arquitectura anclada de los primers favorece un diseño flexible y reduce la pérdida de información durante la preparación de bibliotecas. Combinada con el software Archer™ Analysis, AMP™ permite la corrección de errores sistemáticos, la deduplicación de lecturas y una cuantificación precisa de las moléculas originales, facilitando la detección de variantes puntuales, indels, fusiones génicas y alteraciones en el número de copias con alta sensibilidad y especificidad.
Tipos tumorales recomendados
Cáncer de mama, de pulmón (NSCLC), colorrectal, melanoma y otros tumores sólidos.
Protocolo
El panel está diseñado para su uso con plataformas de secuenciación Illumina®. El flujo de trabajo emplea la tecnología Anchored Multiplex PCR (AMP™) y está estructurado en múltiples pasos que incluyen dos rondas de PCR con primers específicos de gen y adaptadores con códigos de barras moleculares (MBC). La preparación de la biblioteca se completa en aproximadamente un día y medio.
El protocolo está optimizado para ADN libre circulante (cfDNA) y permite trabajar con una cantidad de muestra de entre 5 y 300 ng, obtenida de plasma u otras fuentes compatibles.
Software
Archer™ Analysis es una plataforma bioinformática integral desarrollada por IDT para el análisis automatizado de datos NGS generados con los paneles de la familia Archer®, incluyendo FUSIONPlex™, VARIANTPlex™ y LIQUIDPlex™. Permite realizar análisis moleculares completos a partir de ADN o ARN, adaptados a cada tipo de muestra y aplicación clínica o investigadora.
Es compatible con datos de secuenciación de las plataformas Illumina® —FUSIONPlex™, VARIANTPlex™ y LIQUIDPlex™— e Ion Torrent™ —únicamente FUSIONPlex™—.
La plataforma ejecuta pipelines optimizados para cada tecnología. En el caso de LIQUIDPlex™, permite el análisis de ADN circulante (cfDNA) con máxima sensibilidad, incluyendo SNVs, indels y cuantificación basada en códigos moleculares (MBC) para muestras con bajo porcentaje de variante.
Archer™ Analysis ofrece una interfaz web intuitiva y segura que permite visualizar las variantes detectadas, aplicar filtros personalizados, generar informes automáticos y realizar anotaciones clínicas con herramientas como ClinVar, COSMIC y Ensembl, entre otras bases de datos de referencia.
Diseñada para entornos regulados, proporciona trazabilidad completa, análisis reproducibles y escalabilidad para laboratorios que trabajan con perfiles genómicos avanzados en cáncer, desde investigación hasta aplicaciones clínicas bajo marcado RUO o CE-IVD, según la configuración del panel.
Especificaciones
Amplia capacidad de detección
SNVs, indels y CNVs.
Optimizado para cfDNA
Adecuado para muestras de baja calidad.
Cantidad inicial de material genético
Solo requiere 5 ng de cfDNA.
Compatibilidad universal
Funciona con secuenciadores Illumina®.
Soporte bioinformático
Incluye la plataforma Archer® Analysis para el análisis y la visualización de datos.
Listado completo de genes
Pulse sobre la imagen para ampliar y consultar el listado completo.
Área:
Biopsia Líquida, Sistema Digestivo, Sistema Endocrino, Sistema Reproductor, Sistema Respiratorio, Tipos tumorales, Tumor sólido
Tecnología:
Marca:
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