Archer IMMUNOVerse BCR panel

Principio de funcionamiento

El protocolo utiliza la tecnología Anchored Multiplex PCR (AMP™), que emplea primers gen-específicos unidireccionales (GSPs) para enriquecer tanto alteraciones conocidas como desconocidas. Los adaptadores Archer™ con códigos de barras moleculares (MBCs) e índices de muestra permiten corrección de errores, deduplicación de lecturas y análisis cuantitativo de clonotipos. Los datos generados deben procesarse con el software Archer™ Analysis, que realiza alineamiento de alta confianza, detección de clonotipos y reporte de mutaciones a partir de archivos FASTQ demultiplexados.

Aplicaciones

Uso exclusivo en investigación para el estudio de la diversidad y clonotipos de receptores de células B. Permite aplicaciones como:

• Secuenciación dirigida de ARN de BCR.
• Caracterización de mutaciones somáticas y clonotipos en PBMCs, tejido fresco o FFPE.
• Análisis de clones de alta abundancia o estudios de secuenciación profunda.

Beneficios

• Permite generar librerías listas para secuenciación en pocas horas, con un protocolo sencillo gracias a sus reactivos predispensados en tiras de tubos utilizando códigos de color.
• Alto rendimiento incluso a partir de baja cantidad de ácido nucleico de partida.
• Compatible con una amplia variedad de tipos de muestra (PBMC, tejido fresco-congelado, FFPE).
• Incluye puntos de parada seguros en varias etapas del flujo de trabajo, lo que facilita la planificación experimental.
• El uso de MBCs asegura detección robusta de clonotipos únicos y minimiza artefactos por errores de PCR o secuenciación.
• Permite el procesamiento de muestras individuales, eliminando la espera para la acumulación de las mismas.

Resultados o indicadores clave

El análisis bioinformático reporta métricas de secuenciación y número de observaciones únicas que soportan cada clonotipo detectado, asegurando alta confianza en los resultados.

Tecnología utilizada

Basada en la química AMP™ (Anchored Multiplex PCR) combinada con adaptadores con códigos de barras moleculares (MBCs) y un sistema de doble indexación para multiplexado de muestras en plataformas Illumina®.

Público/usuario previsto

Investigadores en inmunología, oncohematología y biología molecular interesados en el estudio de la diversidad clonal de linfocitos B mediante NGS.

Aspectos Clave

• Tecnología AMP™ para enriquecimiento de alteraciones conocidas y desconocidas.
• Adaptadores MBC con índices duales para deduplicación y clonotipado confiable.
• Kits en formato liofilizado, fáciles de manipular y almacenar.
• Compatible con MiSeq® y NextSeq® (mínimo 300 ciclos).
• Puntos de parada seguros durante el flujo de trabajo.
• Integración con el software Archer™ Analysis para reporte completo y transparente.