Paneles custom de Twist para aplicaciones de NGS

Los paneles custom de Twist son soluciones altamente personalizables, permitiendo seleccionar exactamente las regiones, genes, vías o variantes de interés. Están diseñados para ofrecer alto rendimiento, flexibilidad y precisión en todo tipo de aplicaciones y muestras de partida.

Descripción Detallada

Principio de funcionamiento:

En la práctica, la utilización de paneles custom permite superar las limitaciones de los paneles estándar, ofreciendo al laboratorio control completo sobre qué regiones secuenciar pudiendo diseñar paneles adaptados a preguntas biológicas concretas, evitando aproximaciones genéricas y permitiendo focalizar el análisis en genes, rutas, variantes o regiones específicas.

Para ello, la tecnología de Twist combina una química propietaria para el diseño de sondas de DNA de doble hebra (dsDNA) con su solución de enriquecimiento por captura lo que garantiza una alta calidad y un rendimiento óptimo del panel en aplicaciones tanto de DNA, como de RNA e, incluso, estudios de metilación.

El diseño y los controles de calidad (realizados por NGS) de las sondas están optimizados para garantizar una tasa de uniformidad cobertura excepcional, una alta reproducibilidad, y un elevado ratio de on-target independientemente del tamaño del panel. Con todo ello, la química Twist maximiza la eficiencia de secuenciación aprovechando al máximo los recursos de cada laboratorio.

Además, la modularidad de los reactivos Twist, permite adaptar el uso de estos paneles custom a cualquier tipo de aplicación tanto en contextos germinales como somáticos. Desde muestras de DNA y RNA de buena calidad, obtenidas de fuentes como sangre total, hasta muestras complejas como el cfDNA o las obtenidas de tejido parafinado.

Beneficios

Rendimiento excepcional: elevada uniformidad de cobertura, on-target y reproducibilidad permitiendo obtener el máximo de tus ensayos. Optimización de costes de secuenciación para un uso más eficiente de los recursos Personalización sencilla y ágil con acompañamiento durante todo el proceso. Versatilidad de aplicaciones y tipos de muestra: germinal/somático, DNA/RNA/cfDNA, sangre/FF/FFPE. Automatización disponible en distintos sistemas (Hamilton, Revvity, etc)

Tecnología utilizada:

La plataforma de diseño de Twist incorpora diferentes aproximaciones según el tipo de aplicación:

DNA: paneles personalizados de enriquecimiento dirigido para obtener datos genómicos específicos. Incluye estrategias como probe shifter technology para mejorar el rendimiento y la precisión del diseño, o distintas estrategias de tiling para optimizar la captura de regiones o alteraciones complejas.

RNA: paneles personalizados para capturar datos transcriptómicos a partir de librerías convertidas a cDNA. El diseño utiliza estrategias como exon-aware placement para favorecer la captura de isoformas, fusiones y exones complejos.

Metilación: paneles personalizados de DNA metilado con un diseño que contempla cuatro especies de sonda por target: completamente metilada, completamente no metilada, sentido y antisentido, con el objetivo de conservar la información del patrón de metilación y mantener una alta uniformidad.

Público/usuario previsto:

Solución dirigida a laboratorios y equipos de investigación que necesitan diseñar paneles de NGS personalizados para responder preguntas específicas en estudios de DNA, RNA o metilación. Está especialmente orientada a usuarios que requieren flexibilidad en la selección de targets, alto rendimiento de captura y eficiencia en el uso de la secuenciación.

Uso previsto para microbiología:

Virus: Secuenciación de genoma completo de patógenos desde muestra primaria. Vigilancia epidemiológica. Resistencias antivirales. Metagenómica dirigida

Bacterias: vigilancia genómica. Secuenciación de genoma completo de patógenos desde muestra primaria. Resistencias antimicrobianas. Metagenómica dirigida, tipificación y epidemiología molecular

Aspectos Clave

Control total sobre las dianas a estudiar y personalización ágil de paneles según genes, vías o variantes específicas.

Enriquecimiento de alto rendimiento para DNA, RNA y metilación.

Cobertura uniforme y una elevada proporción on-target, incluso en regiones ricas en GC y complejas. Datos uniformes y reproducibles que reducen revalidaciones.

Captura de isoformas, fusiones y exones de difícil acceso. Detección de variantes raras, CNVs y eventos de baja frecuencia.

Optimización de costes al evitar exceso innecesario de secuenciación y enfoques sobredimensionados.

Automatización

Versatilidad en las aplicaciones y tipos de muestra.

Diseño y asesoramiento con un grupo de soporte experto.

Detalles de Presentación

Disponible en formato de 96 reacciones

Área:

Bacterias, Enfermedad mínima residual, Enfermedades hereditarias y/o raras, Estudio dirigido a patologías específicas, Estudios de clonalidad, Genética molecular, Línea Linfoide, Línea mieloide, Microbiología, Oncohematología, Tumor sólido, Virus

Tecnología:

Secuenciación masiva (NGS)

Marca:

Twist Bioscience

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