AlloSeq HCT es un ensayo de secuenciación masiva indicado para el estudio del quimerismo en aquellos pacientes que han recibido un trasplante de precursores hematopoyéticos. Se fundamenta en la presencia de distintos polimorfismos de nucleótido único para cuantificar, en una muestra postrasplante, la proporción de ADN libre correspondiente al donante y al receptor.
Esta novedosa aplicación de la secuenciación masiva emplea más de 200 SNPs especialmente seleccionados y se le atribuye un límite de detección de hasta el 0,32%. Combina por tanto la sensibilidad de una PCR a tiempo real y la comodidad de usar varios marcadores en todas las muestras que clásicamente se conseguía a través del estudio de STRs.
La preparación de las librerías se completa en tan solo 3 horas, de las que aproximadamente la mitad corresponde al trabajo manual. El ensayo está validado en la plataforma MiSeq y permite secuenciar hasta 24 muestras en cada carrera.
Las secuencias así obtenidas se cargan después en un software específico, que realiza un análisis automático y presenta al usuario distintos parámetros de calidad, que sirven para garantizar la idoneidad de la carrera, y los resultados finales para cada muestra.
